В соответствии с лицензиями Министерства образования №16-028 от 12 ноября 1996 г., №24-0827 от 7 мая 2002 г. и приказами Минобразования №915 от 08.06.1999 г. и №1010 от 04.06.2000 г. в Международной академии маркетинга и менеджмента открыта аспирантура по научной специальности 08.00.05 - «Экономика и управление народным хозяйством (теория управления экономическим системами; экономика, организация и управление предприятиями, отраслями, комплексами) по очной и заочной формам обучения.
Обучение в аспирантуре представляет собой процесс подготовки к сдаче кандидатского минимума, консультирование в выборе темы диссертации, научное руководство и подготовку непосредственно к защите диссертационного исследования. В аспирантуру также можно поступить и в качестве соискателя для сдачи кандидатского минимума или для защиты диссертации.
Для подготовки к сдаче кандидатских экзаменов в академии опытными преподавателями, исключительно докторами и кандидатами наук проводятся занятия по разработанными ими программами. Лекции по специальности, т.е. по экономике и управлению народным хозяйством читаются известным специалистом в этой области, автором многих учебников и монографий, профессором, доктором технических наук, доктором экономических наук Райзбергом Б.А., а также кандидатом экономических наук, профессором Джиоевой В.А. Лекции по философии читают доктор философских наук профессор Волков Ю.Е., кандидат философских наук, доцент Трубникова Н.В. и кандидат философских наук, доцент Емелин В.А., который одновременно осуществляет руководство аспирантурой МАМАРМЕН. Занятия по иностранным языкам ведутся под руководством кандидата филологических наук, доцента Романовской Н.В. В отличие от госвузов, где занятия проводятся, как правило, в дневное время, что крайне не удобно для работающих людей, в МАМАРМЕН практикуется гибкий график занятий, составляемый по согласованию с аспирантами. Для заочников предоставляются методические материалы, чтобы перед экзаменационной комиссией они также были «во всеоружии».

Наряду с обучением в аспирантуре в академии уже несколько лет производится подготовка соискателей по экономическим научным специальностям - успешно защитили диссертации на соискание ученой степени кандидата экономических наук соискатели МАМАРМЕН Р. Генов «Механизм маркетинга книги», М. Петкова «Маркетинговая деятельность в организации книгоиздания и книжной торговли республики Болгария», Клымык О.О. «Иностранные инвестиции и малый бизнес в России» в совете экономического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова, Лоскутова С.А. «Инвестиционные процессы в сфере малого предпринимательства российской экономики» в совете Российской экономической академии им. Г.В. Плеханова, Парошин Г.П. «Управление процессом социального развития работников бюджетных учреждений» в совете Академии труда и социальных отношений, Триус В.В. «Государственное регулирование и рыночные механизмы формирования тарифов на услуги электросвязи», Прохоров А.Ю. «Лизинг как финансовый инструмент развития экономики России» в совете Московского университета потребительской кооперации.
В ходе обучения в аспирантуре аспирантам и соискателям предоставляется возможность издать научные статьи по теме своей диссертации в специализированных сборниках научных работ МАМАРМЕН. Аспиранты очного отделения МАМАРМЕН освобождаются от службы в армии. После защиты кандидатской диссертации в срок и присвоения ученой степени кандидата экономических наук в армию они уже не призываются. Если аспирант успешно выполняет всю программу обучения по научной специальности, но по каким-то причинам не защищается, то ему выдается удостоверение государственного образца о послевузовском образовании.